Uzumaki bercerita tentang kota fiktif bernama Kurouzu-cho, di mana penduduknya mulai terobsesi dan dihantui oleh bentuk spiral. Ceritanya berfokus pada Kirie Goshima dan pacarnya Shuichi Saito, yang menyaksikan secara langsung bagaimana keanehan spiral tersebut mulai merusak dan menghancurkan kehidupan penduduk kota.
Shuichi menyadari pertama kali bahwa sesuatu yang aneh sedang terjadi ketika ayahnya menjadi terobsesi dengan bentuk spiral, sampai-sampai ia mengumpulkan benda-benda berbentuk spiral dan akhirnya kehilangan kewarasannya. Perlahan-lahan, fenomena spiral ini menyebar, memengaruhi orang-orang di sekitar mereka dengan cara yang mengerikan dan tak terduga, seperti tubuh manusia yang berputar menjadi spiral atau perilaku aneh yang dipicu oleh obsesi terhadap bentuk ini.