Tenkuu Shinpan mengisahkan seorang gadis SMA bernama Yuri Honjou, yang tiba-tiba mendapati dirinya berada di dunia aneh penuh gedung pencakar langit yang terhubung dengan jembatan gantung. Di dunia ini, orang-orang diburu oleh sosok bertopeng yang memaksa mereka untuk memilih antara membunuh atau bunuh diri. Para pemburu bertopeng ini tidak hanya kejam tetapi juga memiliki kekuatan dan kemampuan luar biasa.
Yuri berusaha bertahan hidup sambil mencari kakaknya, Rika Honjou, yang juga terperangkap di dunia ini. Sepanjang perjalanan, ia bertemu dengan sekutu dan musuh, mempelajari lebih banyak tentang aturan dan tujuan dunia yang mengerikan ini. Selain bertahan dari para pemburu, Yuri juga harus menghadapi konflik psikologis dan dilema moral ketika memutuskan siapa yang bisa ia percayai di tengah kekacauan.