Takt Op. Destiny: Amerika Serikat berada dalam kekacauan sejak munculnya D2, spesies invasif yang berasal dari meteorit hitam yang jatuh ke Bumi. Sebuah keputusan publik melarang warga memainkan melodi apa pun, untuk mencegah korban lebih lanjut yang disebabkan oleh kebencian D2 terhadap musik—bahkan hingga saat ini, pada tahun 2047, larangan tersebut masih berlaku. Satu-satunya bentuk pertahanan umat manusia terhadap D2 adalah Musicarts, perempuan muda yang mewakili karya musik klasik; dan Konduktor, yang mengendalikan mereka.
Takt Asahina-san, seorang ahli piano yang penyendiri, mendapati dirinya berubah menjadi Konduktor setelah serangan D2 secara spontan. Insiden yang sama membunuh adik perempuan Anna Schneider, Cosette, dan membuat Takt berhubungan dengan Seni Musiknya, Destiny. Mencari cara untuk menstabilkan perjanjian di antara mereka, Takt dan Destiny—bersama Anna—memulai perjalanan berbahaya ke Markas Besar Symphonica di New York City.
Takt terburu-buru untuk mencapai kota agar dia bisa bermain piano lagi, meskipun hasratnya menarik makhluk-makhluk yang selama ini dia benci. Sementara itu, rasa tanggung jawab Destiny menyeret kelompok tersebut ke dalam masalah di sepanjang jalan. Dengan jalur yang dipenuhi D2 dan banyak rintangan sulit di depan mereka, akankah ketiganya berhasil mencapai Kota New York dalam keadaan utuh?
