Net-juu no Susume bercerita tentang Morioka Moriko, seorang wanita berusia 30 tahun, yang telah menghabiskan bertahun-tahun bekerja keras sebagai karyawan kantoran. Merasa lelah dan tidak puas dengan kehidupan nyatanya, dia memutuskan untuk berhenti dari pekerjaannya dan menjadi seorang NEET (Not in Education, Employment, or Training), mengurung diri di rumah dan menghabiskan waktu bermain game online.
Moriko menemukan sebuah game MMORPG baru bernama Fruits de Mer dan menciptakan avatar laki-laki bernama “Hayashi.” Dalam dunia virtual ini, dia dapat melarikan diri dari kenyataan dan menjalani kehidupan yang lebih memuaskan. Di sana, Hayashi bertemu dengan seorang avatar wanita yang ramah bernama “Lily,” yang segera menjadi teman dekat dan rekan petualangannya.
Tanpa disadari, Moriko semakin terikat dengan Lily dan merasakan kenyamanan serta kebahagiaan yang tidak pernah ia temukan di dunia nyata. Namun, Moriko tidak tahu bahwa di balik avatar Lily ada seorang pria muda bernama Sakurai Yuuta, yang juga menemukan kenyamanan dalam dunia game setelah mengalami kesulitan dalam hidupnya.
Seiring waktu, kehidupan Moriko di dunia nyata dan dunia game mulai beririsan, terutama setelah dia bertemu dengan Yuuta di kehidupan nyata tanpa menyadari bahwa dia adalah Lily. Hubungan mereka berkembang di dunia nyata dan virtual, menciptakan situasi yang lucu dan mengharukan saat mereka berdua berusaha mengatasi perasaan mereka dan tantangan kehidupan sehari-hari.
