Mikakunin de Shinkoukei berkisah tentang Kobeni Yonomori, ia adalah seorang gadis SMA yang biasa, menjalani kehidupan normalnya tanpa masalah berarti. Namun, pada ulang tahunnya yang ke-16, hidupnya berubah secara drastis ketika dia diberitahu bahwa dirinya telah bertunangan dengan seorang pria yang tidak pernah ia kenal sebelumnya.
Pria tersebut adalah Hakuya Mitsumine, yang tiba-tiba muncul di rumah Kobeni bersama adik perempuannya, Mashiro. Hakuya, yang pendiam dan misterius, serta Mashiro, yang imut namun agak aneh, segera pindah untuk tinggal bersama keluarga Kobeni. Meskipun awalnya terkejut dan bingung, Kobeni berusaha menerima situasi ini dan belajar lebih banyak tentang tunangan barunya.
Seiring berjalannya waktu, Kobeni mulai menyadari bahwa keluarga Mitsumine bukanlah keluarga biasa. Mereka memiliki rahasia besar yang berkaitan dengan asal usul mereka yang tidak sepenuhnya manusia. Meskipun demikian, Kobeni mulai mengembangkan perasaan terhadap Hakuya, sementara Mashiro dengan lucunya mencoba menyesuaikan diri dengan kehidupan manusia.
