Magikano berkisah tentang Haruo Yoshikawa, seorang siswa SMA yang menjalani hidup biasa tanpa menyadari bahwa dunia di sekitarnya penuh dengan sihir. Meskipun Haruo tidak mengetahui hal ini, ketiga saudara perempuannya—Maika, Chiaki, dan Fuyuno—adalah penyihir yang terus menggunakan sihir untuk melindunginya dari bahaya tanpa sepengetahuannya.
Suatu hari, seorang gadis bernama Ayumi Mamiya muncul di kehidupan Haruo. Ayumi adalah seorang penyihir yang terkena kutukan yang akan membuatnya kehilangan kekuatan sihir jika tidak berhasil membebaskannya. Untuk mengangkat kutukan itu, dia harus membuat Haruo jatuh cinta padanya, karena Haruo adalah kunci untuk menyelamatkan Ayumi dari nasib tersebut. Ayumi pun mulai mendekati Haruo, tetapi saudara-saudara perempuannya tidak tinggal diam dan melakukan segala cara untuk mencegah Ayumi mendekati Haruo.