Ao no Hako ceritanya mengikuti Taiki Inomata, seorang anggota tim bulu tangkis di SMA Eimei. Taiki sangat mengagumi Chinatsu Kano, seorang siswa senior yang juga merupakan atlet basket berbakat di sekolah yang sama. Taiki menyimpan perasaan untuk Chinatsu, tetapi belum memiliki keberanian untuk mengungkapkannya.
Chinatsu adalah bintang baru di tim bola basket, dan jarak antara dia dan Taiki sangat besar. Meskipun Taiki adalah pemain bulu tangkis yang lumayan berbakat, popularitasnya jauh dari Chinatsu, sehingga kecil kemungkinan perasaannya akan terbalas.
Namun suatu hari, situasi tak terduga terjadi ketika Chinatsu, karena alasan keluarga, harus tinggal di rumah Taiki. Ini memberikan kesempatan bagi mereka untuk lebih dekat, meskipun hubungan mereka tetap penuh dengan kecanggungan. Sementara itu, Taiki tetap berjuang untuk mengasah keterampilan bulu tangkisnya, berusaha keras untuk mencapai turnamen nasional dan menjadi pemain yang lebih baik.
